产量区别：海水珍珠主要产自白蝶珍珠母贝，产量很少，一个贝里只能孕育一两颗珍珠，而淡水珍珠的产量是比较大的，因此价格上也比海水珍珠要便宜。海水珍珠的养殖时长一般为3-5年，甚至5年以上。在养殖过程中，需创造良好的环境条件，才能培育优质珍珠。更重要的是一个母贝一生只能孕育一颗珍珠，且成活率低，品质和产量的原因使同等条件下的海水珠跟淡水珠价值相差了四五倍。

形状上区别：自古以来就有“珠圆玉润”的说法，即珍珠越圆润则说明品质越优异，而海水珍珠就是正圆形比较多，淡水珍珠形状各异，在美观度上自然是不如海水珍珠的。海水珍珠的光泽度也比淡水珍珠更水润些，在阳光下能显得生动多彩。海水珍珠每个母贝只养殖一颗珍珠，在成长的过程中没有其它的珍珠与它接触、碰撞，因此它的形状也更加圆润，最高能达到极正圆级别。不仅如此，个头大，光泽鲜亮，这些都是淡水珍珠所不能及的。

颜色区别：海水珍珠的颜色丰富，有白色、金色、黑色等基色，加上晕彩多变，更富有层次，也更富有质感。