马皇后的儿子有明朝燕王朱棣、周定王朱驹、义文太子朱标、秦闵王朱秀、金公王朱亮。

　　据《明史》记载，马皇后生了宁国公主、安庆公主等五子二女。

　　但明末清初史学家潘大章在《国史研究》中说，根据明朝皇室族谱，明成祖太祖四子朱棣、五子周定王所生的孝慈皇后高郎英在《七修类稿》中说:“孝慈高皇后有两个儿子，这在《吕府豫志》中有记载。明代王宗元所著《南京太常寺志》中说:“孝陵王位，左李妃，生依文亲王，秦闵王，金公王。右李公主，生朱文帝(朱棣)，孙公主，生周定王(朱棣)。清代诗人朱义尊《经之居诗》卷十三沈元华说:“南京皇庙奉贤殿高孝慈皇后牌位南，东列嫔妃灵位，西独高孝慈皇后灵位。”高孝慈皇后从未怀孕过，易文太子也不是她所生的。”

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